Фамилия Игнатьев-Бородухин — двойная, и её части рассказывают о происхождении предков с двух сторон: по одной линии родословной они получили фамилию от церковного имени, по другой — от прозвища, связанного с внешностью.

Первая часть, Игнатьев, образована от мужского крестильного имени Игнатий (в переводе с латинского — «огненный»). Среди Игнатьевых есть и графский, и дворянские роды. Один из самых известных ведет начало от Федора Бяконта, а его праправнук Игнатий Константинович дал фамилию своим потомкам. В истории рода упоминаются Федор Иванович Игнатьев, постельничий при Михаиле Федоровиче, и Степан Лукич Игнатьев, генерал-поручик и санкт-петербургский обер-комендант. В 1877 году генерал-адъютант Павел Николаевич Игнатьев получил графский титул. Род Игнатьевых был внесен в VI часть родословных книг сразу нескольких губерний: Новгородской, Смоленской, Тверской, Тульской, Московской и Псковской.

Вторая часть, Бородухин, имеет другую природу. Она происходит от прозвища Бородуха, которое образовано от слова «борода» — волосяной покров нижней части лица. Прозвище, скорее всего, дали человеку с густой или длинной бородой. Такие прозвища были распространены на Руси: борода считалась признаком зрелости, мудрости или просто заметной внешней чертой. Суффикс -ух- в основе Бородух- характерен для прозвищ, образованных от существительных (сравните: толстуха, грязнуха), а фамильный суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Бородухи».

Соединение двух фамилий в одну — Игнатьев-Бородухин — могло произойти при браке представителей разных родов или для сохранения памяти о менее знатной, но яркой по происхождению ветви. Если Игнатьевы — фамилия с долгой дворянской историей, то Бородухин — фамилия более народная, прозвищная, и вместе они создают контраст: книжное, церковное начало и бытовое, наглядное прозвище.