Фамилия Игнаточкин образована от мужского крестильного имени Игнатий. В переводе с латинского оно означает «огненный», хотя встречается и версия «неведомый». В основу фамилии легла не полная, а производная форма имени — Игнаточка. Такая уменьшительно-ласкательная модель (Игнатий → Игнаточка) была обычной в русской бытовой среде: так в семье или в соседском кругу называли человека, которого хотели выделить с теплотой или просто для удобства в повседневной речи.

Сама фамилия построена по типичной для русского ономастикона схеме: к основе Игнаточк- добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Игнаточкин буквально означает «чей?» — сын, потомок или человек из рода Игнаточки. По сути, это патроним, который со временем закрепился как наследственная фамилия.

С точки зрения словообразования интересно, что суффикс -ин здесь присоединился к основе, оканчивающейся на -к-, что для русского языка редкость: обычно в таких случаях используют суффикс -ов (ср. Игнатов, а не Игнаткин). Однако форма Игнаточка дала именно -ин, что говорит о её восприятии как имени на -а (ср. Фомин, Савин). Это делает фамилию Игнаточкин более редкой по сравнению с массовыми Игнатовыми и Игнатьевыми.

Поскольку имя Игнатий было распространено во всех сословиях, однозначно определить социальное происхождение Игнаточкиных сложно. Однако уменьшительная форма Игнаточка чаще встречалась в крестьянской и мещанской среде, где полные имена в быту заменялись ласкательными вариантами. Фамилия могла закрепиться в разных регионах, но наиболее вероятна её фиксация в центральных и северных губерниях России, где была сильна традиция патронимов на -ин.

Таким образом, Игнаточкин — это фамилия, которая напрямую отсылает к имени предка и сохраняет в себе живую разговорную форму, не потерявшую связи с исходным значением «огненный».