Фамилия Игнатий — относительно редкая, так как образована напрямую от полной формы крестильного имени, без типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Чаще всего её носили выходцы из духовного сословия: в среде священников и монахов было принято записывать фамилию по имени отца или по церковному прозвищу, не добавляя окончания, свойственного крестьянским родам. В некоторых случаях фамилия могла закрепиться за семьями, где имя Игнатий передавалось из поколения в поколение, постепенно став родовым прозванием.

Само имя Игнатий происходит от латинского ignis — «огонь», то есть «огненный». В православных святцах известно 14 святых покровителей этого имени. Самый почитаемый из них — Игнатий Богоносец, епископ Антиохийский. Предание говорит, что его брал на руки младенец Иисус, за что святой и получил прозвище Богоносец. Игнатий стал одним из первых христианских писателей нееврейского происхождения и пострадал за веру при императоре Траяне: его отдали на растерзание львам в Риме.

В бытовой речи имя часто сокращали: отсюда пошли более привычные фамилии Игнатов, Игнатьев, Игнашин. Фамилия же Игнатий в неизменной форме встречается в основном у потомков церковнослужителей и в некоторых южнорусских и украинских регионах, где сохранялась традиция фамилий-имён без суффиксов.