Фамилия Игонченко — типичный пример украинской модели фамилии на -енко, самой распространённой в этой ономастике. Суффикс -енко исторически означал «маленький», «сын» или «потомок», поэтому Игонченко — это «сын Игонта» или «потомок Игона». В основе лежит прозвище или неканоническое имя Игонт, которое само по себе почти не встречается в документах, но хорошо реконструируется через уменьшительные формы.

Вероятнее всего, Игонт — это производное от христианского имени Игнатий (от латинского ignis — «огонь»). В украинской народной традиции имя Игнатий сокращали до форм вроде Ігнат, Ігон, а затем добавляли суффикс -т (как в парах «Клим — Климент», «Пал — Палет»). Получается цепочка: Игнатий → Ігнат → Ігон → Ігонт → Игонченко. Реже, но возможно, что корень связан с глаголом «игнуть» (гнуть, сгибать) — тогда прозвище Игонт могло относиться к человеку сгорбленному или сутулому, но эта версия менее правдоподобна, так как в украинских говорах такое слово не фиксируется.

Географически фамилия Игонченко тяготеет к центральным и восточным областям Украины — Черкасской, Полтавской, Сумской, где суффикс -енко исторически доминировал. В России она редка и встречается в основном в южных регионах, куда шли переселенцы из Малороссии. Сословная принадлежность предков, скорее всего, была крестьянской или казацкой: фамилии на -енко в XVIII–XIX веках массово закреплялись за простыми людьми, реже — за мещанами.

Интересная деталь: написание через -о- (Игонченко, а не Игнатченко или Игнатенко) указывает на местное произношение, где звук -а- после мягкого согласного перешёл в -о- — явление, типичное для полтавских и киевских говоров. Таким образом, фамилия сохранила живую фонетику речи предков, а не книжную форму.