Фамилия Ихтонов — редкий пример, когда в основе лежит не славянское слово, а греческое «ихтион» (ἰχθύς), то есть «рыба». Если кратко: перед нами, скорее всего, калька, то есть перевод другой фамилии, чаще всего Рыбин или Рыбкин, на греческий лад. Такое могли сделать в среде духовенства: семинаристам нередко меняли «простонародные» фамилии на более благозвучные, образованные от греческих или латинских корней. Так появились Кусто́диевы (от лат. custos — страж), Сперанские (от лат. spero — надеюсь) и, вероятно, Ихтоновы.

Вторая версия — священническая, но связанная не с бытовым прозвищем, а с символом. Рыба (греч. ἰχθύς) была тайным знаком первых христиан: пять букв этого слова составляли акроним «Иисус Христос, Сын Божий, Спаситель». Фамилию могли дать выпускнику духовной семинарии как намёк на чистоту веры или в память о евангельских сюжетах. Поэтому Ихтонов — не просто «рыбная» фамилия, а потенциально несущая богословский подтекст.

Обратите внимание на суффикс. В русском языке -ов обычно присоединяется к основам мужского рода: Иванов, Петров. Но греческое «ихтион» — среднего рода, и по правилам следовало бы ждать формы Ихтонин (как Розин от «роза» женского рода). Однако фамилия закрепилась именно как Ихтонов — возможно, под влиянием более привычной модели или потому, что исходное слово воспринимали как мужское (ср. Ихтион — персонаж мифов или название рыбы в научной латыни). Это лишний раз указывает на искусственное, «кабинетное» происхождение фамилии.

Географически Ихтоновы встречаются редко, что подтверждает её не массовое, а скорее индивидуальное возникновение. Встречаются носители в центральной России и Поволжье — тех регионах, где были сильны духовные училища и семинарии. Сословно это почти наверняка потомки священно- и церковнослужителей, реже — выходцы из мещан, получивших фамилию при записи в метрические книги.

В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна) фамилия не упоминается, что делает её особенно интересной для самостоятельного семейного поиска: если вы Ихтонов, ваши предки, скорее всего, имели отношение к церкви, а сама фамилия — не случайный набор звуков, а осмысленное имя, данное при обучении или рукоположении.