Фамилия Ильиницкая — женская форма фамилии Ильиницкий, и её происхождение напрямую связано с крестильным именем Илья. В основе лежит каноническая форма Илия, которая пришла на Русь из греческого языка. Однако в фамилии Ильиницкая работает не обычная патронимическая модель (Ильин, Ильичев), а другая, более редкая словообразовательная схема.

Суффикс -ицк- (в мужском варианте -ицкий) указывает на формирование фамилии по географическому или топонимическому принципу. Чаще всего такие фамилии получали дворяне по названию своих поместий, а также выходцы из местечек, сёл или городов. Иными словами, предок носителя фамилии Ильиницкий мог владеть землёй или жить в населённом пункте, который назывался Ильиницы, Ильиничи или как-то похоже. Такие топонимы, в свою очередь, образованы от того же имени Илья: село Ильиницы могло принадлежать человеку по имени Илья или быть названным в честь церкви Ильи Пророка.

В отличие от массовых фамилий на -ов/-ев или -ин, которые давали крестьянам и горожанам, фамилии на -ский/-цкий в XVII–XIX веках чаще встречались среди шляхты в западных и юго-западных землях Российской империи (современные Украина, Беларусь, Польша). Поэтому географически фамилия Ильиницкая тяготеет к этим регионам. Мужская форма Ильиницкий зафиксирована в списках православного духовенства и мелкопоместных дворян Волынской, Киевской и Подольской губерний.

В написании фамилии возможна путаница с более распространённой фамилией Ильиничская. Разница в одной букве, но происхождение разное: Ильиничская — от отчества Ильинична (дочь Ильи), а Ильиницкая — от топонима или прозвища на -иц-. Таким образом, Ильиницкая — фамилия не «от имени», а «от места», связанного с именем.