Фамилия Илко — редкий случай, когда географическое происхождение прослеживается почти однозначно. Если вы встретили эту фамилию, скорее всего, её носители родом с запада Украины или из Беларуси. В центральной России она почти не встречается, а на юге — тем более.

На первый взгляд кажется, что основа — «Илк» — может быть вариантом имени Илья (в некоторых говорах «Илько»). Но тут работает суффикс -ко, типичный для украинской и белорусской ономастики. В этих языках -ко образует уменьшительно-ласкательные формы имён или прозвищ: Илко — это «маленький Илья» или «Илюшка». Однако есть и вторая версия, не менее правдоподобная: фамилия могла закрепиться за человеком, которого называли по занятию. В польском и украинском языках «ілка» — диалектное название иглы или чего-то колющего. Тогда Илко — прозвище портного, сапожника или, в переносном смысле, колкого, язвительного человека.

Третий вариант, который приводят ономасты (например, в работах по антропонимии Подолья), — связь с тюркским корнем «илк» (первый, начальный). Но эта версия слабая: фамилия почти не встречается в регионах татарского влияния, а суффикс -ко для тюркских основ нетипичен.

Самый простой и надёжный разбор: Илко — это украинская или белорусская форма от Илья, застывшая в виде фамилии без дополнительных суффиксов (как Иванко, Петро, Стецько). Такие фамилии не склоняются по падежам в русском языке. В дореволюционных метриках её могли записать как «Илков» или «Ильков», но носители сохранили исходный вариант.