Фамилия Илотовский — редкая и неоднозначная с точки зрения происхождения. Её основа — «Илот» — сразу отсылает к истории Древней Греции: илотами называли земледельцев в Спарте, находившихся в положении, близком к рабскому. Однако напрямую выводить фамилию из этого термина было бы поспешно. Скорее всего, перед нами искусственная, семинарская фамилия, которую могли дать в духовных училищах XVIII–XIX веков. Семинаристам нередко присваивали «учёные» фамилии на -ский, образованные от латинских, греческих или церковных слов. Илотовский — один из таких случаев: наставники могли наградить ею ученика за мрачный или покорный нрав, либо просто ради книжной экзотики.

Модель образования типична для русского дворянского и духовного сословия: суффикс -овск-/-евск- и окончание -ий указывают на принадлежность к чему-либо. В бытовой, народной среде фамилии на -ский обычно давались по названию местности (села или города), но «Илотовский» ни к одному известному топониму не привязан. Это ещё один аргумент в пользу искусственного происхождения: фамилия не выросла из прозвища, а была сконструирована.

Есть и вторая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «илот» могло быть искажением слова «илотовый» — относящегося к илу, глинистой почве. Тогда Илотовский — человек, живший на болотистой или илистой земле. Но эта гипотеза слабая: ни в словарях русских говоров, ни в ономастических работах такое прозвище не зафиксировано.

Фамилия крайне редкая. В современных справочниках и базах данных она почти не встречается, что подтверждает её «кабинетное» происхождение. Носители Илотовских, скорее всего, происходят из семей выпускников духовных семинарий — особенно в центральных губерниях России, где такие фамилии были распространены.