Имя Илюнька представляет собой производную форму имени Илья, которое с древнееврейского переводится как «господь мой – Бог». Скорее всего, основатель рода Илюнькиных был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Илюнька, со временем получил фамилию Илюнькина.