Основой фамилии Илюнькина послужило церковное имя Илья. Имя Илюнька представляет собой производную форму имени Илья, которое с древнееврейского переводится как «господь мой – Бог». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Илюнька, со временем получил фамилию Илюнькина.