Фамилия Именахунов — редкая и морфологически нестандартная для русского уха. Её основа, суффикс и даже ареал бытования сразу указывают, что перед нами не исконно русская, а тюркская или кавказская фамилия, адаптированная русским окончанием -ов. Разбирать её по схеме «от имени Ивана» здесь бессмысленно: корень «Именахун» — цельное составное имя.

Словообразовательная модель проста: к полному личному имени «Именахун» добавили русский патронимический суффикс -ов (чей? — Именахунов). Это типичный пример русификации фамилий народов Северного Кавказа, Поволжья или Средней Азии в XIX–XX веках, когда при записи в метрики или советские документы к местному имени прикрепляли стандартное русское окончание.

Само имя Именахун — сложное. Скорее всего, оно восходит к арабскому «иман» (вера, верующий) и тюркскому или персидскому «хун» (кровь, род, происхождение). Буквально: «кровь веры», «род верующего». В исламской ономастике такие двухкорневые имена с компонентом «иман» часты (Иманбек, Имангул, Иманбай). Окончание «-хун» может быть искажённым «-хан» (владыка, правитель), что даёт значение «верный хан» или «хан веры». Вторая версия: «хун» — это «солнце» в некоторых тюркских языках (ср. «кюн», «гюн»), тогда имя означало бы «солнце веры». Но это менее вероятно, так как форма «хун» в значении «солнце» характерна для юго-восточных тюркских диалектов.

Географически фамилия Именахунов встречается в основном в Дагестане, Чечне, а также среди татар и башкир. В русских переписных книгах XVI–XVII веков её нет — это позднее образование, закрепившееся в советское время. Сословная принадлежность носителей не прослеживается: имя мог получить и крестьянин, и сельский мулла, и ремесленник.

С точки зрения ударения, в русском произношении оно падает на третий слог: Именаху́нов. В оригинале, в языках-источниках, ударение могло быть на любой части слова. Эта фамилия — хороший пример того, как русская грамматика «накрыла» иноязычное имя, сохранив его звучание, но изменив функцию.