Фамилия Иманахунов образована от мужского тюркского имени Иманахун. Первая из них восходит к имени Иман, которое в переводе с арабского означает «вера, вера в Аллаха, верование». Вторая часть ведет свое начало от персидского имени Ахун - «наставляющий на путь истины», «учитель, наставник», «близкий человек».