Фамилия Инербаев — один из тех случаев, когда корень слова не сразу поддается расшифровке, но суффикс и модель образования выдают происхождение с головой. Это типичная тюркская фамилия, образованная по башкирской или казахской модели: основа + аффикс принадлежности -бай + русский патронимический суффикс -ев. В основе лежит имя или прозвище Инербай, где первая часть — «инер» (варианты: инэр, инар) — может восходить к арабскому «инар» (свет, огонь) или к тюркскому «инер» (вера, убеждение). Вторая часть, -бай, в тюркских языках означает «богач», «хозяин», «господин» и часто служила компонентом личных имен, указывая на достаток или статус.

Инербай — составное имя, типичное для дореволюционной Башкирии и Казахстана. Такие имена давали с пожеланием благополучия: «богатый верой», «обладающий светом». Позже, при переходе в русскую документацию, к имени Инербай добавили суффикс -ев, который в XIX веке стандартно оформлял фамилии выходцев из тюркской среды. Встречается также вариант Инербаев с ударением на второй слог, что характерно для южноуральских говоров.

Географически фамилия привязана к Башкортостану, Оренбургской и Челябинской областям. В метрических книгах и ревизских сказках XIX века Инербаевы — чаще всего тептяри или башкиры-вотчинники, реже — казахи, перешедшие в оседлость. Сословно это были государственные крестьяне или казаки, редко — купцы. Своеобразная деталь: в некоторых записях фамилию писали через «ы» — Ынербаев, что отражает твердое произношение начального гласного в тюркских языках.

Искать однокоренные фамилии стоит среди тех, что заканчиваются на -баев: Акбаев, Темирбаев, Сарыбаев. Инербаев стоит в этом ряду обособленно из-за редкого корня «инер», который почти не встречается в других русских фамилиях. Это делает фамилию легко узнаваемой и однозначно указывает на тюркские корни, скорее всего башкирские.