Фамилия Инняева — редкий случай, где современное звучание почти полностью скрыло исходный смысл. Если не знать, куда смотреть, легко заподозрить в ней что-то тюркское или финно-угорское. На деле перед нами типичная русская фамилия, образованная по модели «Инняй + -ев(а)», где основа — некалендарное или диалектное прозвище.

Ключ к разгадке — суффикс «-ев», а не «-ин». Это значит, что основа мужского имени или прозвища оканчивалась на мягкий согласный или «й»: Инняй, Иняй, Инней. Сама основа, скорее всего, восходит к русскому диалектному слову «иня» или «иння» — так в некоторых говорах называли иней, изморозь. Прозвище Инняй могли дать человеку с седыми волосами, бледной кожей или холодным, отстранённым характером. Менее вероятна, но возможна связь с уменьшительной формой крестильного имени Иннокентий (Иння, Инюта), однако для фамилии Инняева такая модель встречается реже: обычно от Иннокентия образуют Иннокентьев или Инютин.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным регионам России — Вологодской, Архангельской, Костромской областям. Именно там диалектное слово «иня» было в ходу, и именно там закрепилась модель фамилий на «-яев»/«-еев» от прозвищ на «-яй» (сравните: Болтаев от «болтай», Лепяев от «лепяй»). В южных и восточных областях фамилия практически не встречается, что косвенно подтверждает её севернорусское происхождение.

Женская форма Инняева — это, разумеется, вариант по мужу или отцу. Мужской вариант — Инняев. Оба образованы по одному принципу: от прозвища отца. Носитель фамилии мог быть сыном или потомком человека по прозвищу Инняй. Сословной привязки нет: прозвище могли носить и крестьяне, и посадские, и даже священнослужители (в быту, а не по документам). Дворянских родов с такой фамилией в исторических источниках не зафиксировано.

В написании фамилии встречается вариативность: иногда путают двойное «н» и «е» в окончании (Инняева/Иняева). Правильный вариант с двумя «н» — «Инняева» — закрепился в метрических книгах XIX века, хотя в устной речи двойное «н» не произносится. Это одна из тех фамилий, где орфография точнее хранит историю, чем произношение.