Фамилия Инокова — женская форма мужской фамилии Иноков. Её основа сразу задаёт направление поиска: слово «инок» означает монаха, отшельника, человека, принявшего постриг. В древнерусском языке «инокъ» (от греческого «монахос» — «одинокий, уединённый») было общеупотребительным обозначением чернеца. Казалось бы, логично предположить, что предок носителя фамилии был монахом. Но здесь кроется ловушка: монахи, принимая постриг, отказывались от мирской фамилии и рода, поэтому прозвище «Инок» в прямом смысле дать церковному лицу было бессмысленно.

Вероятнее всего, прозвище Инок дали мирянину — либо за внешнее сходство с монахом (аскетичная внешность, тихий нрав, склонность к уединению), либо за то, что он часто бывал при монастыре, работал там или жил по соседству. В русских говорах слово «инок» могли применять иронично к человеку нелюдимому или, наоборот, к тому, кто вёл себя подчёркнуто благочестиво. Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ: «чей?» — Иноков, то есть сын или потомок человека по прозвищу Инок.

Менее распространённая, но возможная версия — связь с топонимом. В некоторых регионах России встречаются селения с корнем «Инок-» (например, Иноковка в Тамбовской области). Тогда фамилия могла образоваться от названия местности, где жил основатель рода. Сравните с фамилиями Казанцев, Москвин — они тоже от географических названий, но с другим суффиксом.

В дореволюционных источниках фамилия Иноков встречается нечасто. Она не относится к числу распространённых дворянских или купеческих фамилий — скорее, это крестьянская или мещанская фамилия из центральной России. Поскольку в словарях (например, у Б. Унбегауна или В. Никонова) Иноков не выделяется как отдельная статья, можно опираться на типовую модель: прозвище + -ов. Сегодня носители фамилии Инокова живут в основном в Поволжье и на Урале, что косвенно подтверждает её «нестоличное» происхождение.