Фамилия Инженер — редчайший случай в русской ономастике: она образована не от прозвища или имени, а напрямую от названия профессии, причём профессии, которая появилась в России поздно. В отличие от Кузнецовых или Мельниковых, Инженеры не могли возникнуть в крестьянской среде — вплоть до XVIII века на Руси не было ни инженерного дела, ни самого слова.

Слово «инженер» пришло в русский язык при Петре I из польского или немецкого (Ingenieur), а корнями уходит в латинское ingenium — «врождённая способность, остроумие, изобретательность». Первоначально так называли военных специалистов по фортификации и осадным работам. Поэтому фамилия Инженер почти наверняка имеет искусственное происхождение: её могли дать в духовных училищах или семинариях (где любили «говорящие» фамилии по латинским и греческим корням), либо получить в дворянской среде как «перевод» немецкой фамилии Ingenieur. Второй вариант — фамилия могла быть пожалована за заслуги, но это единичные случаи.

По модели образования фамилия стоит особняком. Она не имеет типичных русских суффиксов -ов, -ев, -ин, которые указывали бы на принадлежность («чей сын?»). Это так называемая «калькированная» или «прозвищная» фамилия, оставленная в чистом виде, без патронимического оформления. Встречается она крайне редко и географически привязана к крупным городам и военным гарнизонам XVIII–XIX веков — Петербургу, Москве, а также южным крепостям, где служили военные инженеры.

Спорных версий здесь немного. Самая маловероятная — что фамилия произошла от старого прозвища «инженер» в значении «хитрец, выдумщик»: это слово долго не ассимилировалось в народной речи, и вряд ли крестьяне так называли друг друга. Куда правдоподобнее, что фамилию носили потомки первых русских инженеров — либо обрусевших иностранцев, приглашённых Петром, либо выпускников Школы математических и навигацких наук. Документальных подтверждений массового бытования фамилии нет: в дореволюционных справочниках она почти не фиксируется, что говорит о её штучном характере.

Сегодня носители фамилии Инженер встречаются единично по всей России и в странах бывшего СССР. Фамилия настолько редкая, что её обладатель почти наверняка является потомком конкретного человека, получившего эту фамилию в XVIII–XIX веках. Поиск предков здесь, скорее всего, приведёт к военным архивам или формулярным спискам инженерного корпуса.