Фамилия Иофанова — женская форма фамилии Иофанов, которая, в свою очередь, образована от мужского имени Иофан. Само имя Иофан — это редкая в русском обиходе форма древнееврейского имени Иоанн (в русской традиции — Иван). Если имя Иван стало самым распространённым на Руси, то Иофан — его усечённый, почти книжный вариант, который мог бытовать в среде духовенства или в семьях, где ценили церковнославянское звучание. Переход «Иоанн» → «Иофан» объясняется просто: в некоторых диалектах и при быстром произношении звук «н» перед гласным мог озвончаться или заменяться на «ф» под влиянием греческого произношения (в греческом языке звук «ф» встречается там, где в еврейском был «в» или «п»). Таким образом, Иофанов буквально означает «сын Иофана», то есть потомок человека, носившего это имя.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: фамилию давали по имени отца. Однако есть и вторая, менее очевидная версия происхождения. В некоторых говорах слово «иофан» могло быть прозвищем, связанным с глаголом «иофанить» — так в архангельских и вологодских краях называли человека, который говорит быстро, невнятно или «гундосит». Но эта версия слабая: глагол редкий, и маловероятно, что от него образовали бы фамилию с таким же корнем, как у библейского имени. Основной и надёжный путь — от крестильного имени.

Фамилия Иофанов — редкая. Она не встречается массово ни в одном регионе, но её очаги можно найти в центральной России и, возможно, среди потомков духовного сословия, где было принято давать детям «календарные» имена в полной, не сокращённой форме. Женская форма Иофанова закрепилась за женщинами — дочерьми или жёнами Иофановых. Поскольку фамилия не была дворянской или купеческой, её носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, получившими фамилию при переписях XIX века по имени отца. В отличие от фамилий вроде Иванов, Иофанов сохранила архаичный, почти «библейский» оттенок — это главное, что отличает её от десятков тысяч однокоренных фамилий на -ов.