Фамилия Ионенская — редкий пример фамилии, образованной от женской формы с помощью суффикса притяжательности. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать её на две части: корень «Ион» и суффиксы «-ен» и «-ск».

Основа «Ион» восходит к библейскому имени Иона (др.-евр. «голубь»). В православной традиции это имя носил один из двенадцати малых пророков, поэтому оно было распространено в среде духовенства и крестьян. Однако в фамилии Ионенская мы видим не прямое отчество (типа Ионов), а более сложную модель: сначала от имени Иона образовали женское имя или прозвище Иона (с уменьшительным суффиксом «-еня»), а затем от него — фамилию с суффиксом «-ск», который чаще всего указывает на принадлежность к местности или роду.

Ключевая особенность — суффикс «-ен» перед «-ск». Он говорит о том, что фамилия могла возникнуть не от мужского имени, а от женского — например, от Ионеня (ласкательной формы имени Иона, характерной для северных и центральных говоров). Фамилии на «-ский» часто давали священникам или детям священнослужителей, а также жителям определённых мест. В данном случае Ионенская могла означать «дочь или жена того, кого звали Ионеня», или же «принадлежащая к селению, где жили Ионенята».

Географически фамилия редкая. Её носители встречаются в основном в центральной России и на Урале — регионах, куда в XVII–XVIII веках ссылали старообрядцев и переселяли крестьян. Не исключено, что предок носителя фамилии был выходцем из духовного сословия: фамилии на «-ский» часто закреплялись за выпускниками семинарий, где ученикам давали фамилии по именам святых (Иона — один из них). Но в отличие от массовых Ионовых или Иониных, форма Ионенская сохранила женский след — возможно, от матери-вдовы или от прозвища, данного по хозяйке дома.

Спорных версий здесь немного. Вариант, что фамилия происходит от географического названия (например, деревни Ионенки), маловероятен: таких топонимов не зафиксировано. Также маловероятно, что корень связан с греческим «ион» (фиолетовый) — это натяжка, не подтверждённая ономастикой. Самая правдоподобная версия — именно женская основа с семинарским «-ский».