Фамилия Иотка — редкий пример, где разбор начинается не с имени, а с местного костромского глагола. В основе лежит слово «иотить», что в костромских говорах означало «подать голос», «высказать мнение» или «дать совет». Суффикс -к- в фамилии выполняет уменьшительную или прозвищную роль, как в словах «малышок» или «зайка». Если соединить глагол и суффикс, получается характеристика человека: невысокого роста, но с характером — тот, кто не молчит, а решителен в суждениях. В таком случае прозвище Иотка могло означать «маленький советчик» или «решительный коротышка».

Есть и вторая версия, которая выводит фамилию за пределы русских говоров. Литовское слово joti переводится как «ехать верхом». Здесь Иотка — прозвище отличного наездника. Эта гипотеза правдоподобна, если учитывать, что фамилия встречается в регионах, граничивших с Великим княжеством Литовским, или у потомков литвинов. Однако первая версия — с костромским глаголом — выглядит убедительнее: она объясняет и русскую суффиксальную модель, и характерный для северных говоров корень.

Фамилия не получила широкого распространения и не стала дворянской. Скорее всего, Иотка — это прозвище одного человека, которое закрепилось за его потомками в одной-двух местностях. По словообразованию фамилия относится к типу «безоформных» — то есть не имеет окончания -ов, -ин или -ский, а сохраняет исходное прозвище в чистом виде. Такие фамилии чаще встречались на западе и северо-западе России, в том числе в Костромской губернии.