Фамилия Ипкеева — редкий пример, где основа, скорее всего, не славянская, а тюркская. В русском языке её оформляет типичный для фамилий суффикс притяжательности -ев, который указывает на принадлежность: «чей?» — Ипкеев. Женская форма Ипкеева образована по тому же правилу, что и у подавляющего большинства русских фамилий.

Корень «Ипкей» (или «Ипке») с большой вероятностью восходит к тюркскому личному имени. В тюркских языках, особенно в татарском, башкирском, казахском, есть имя Ипкей, которое, в свою очередь, может быть производным от арабского Ибрагим (Ибрахим) — библейского Авраама. В народной речи сложные имена нередко усекались и упрощались: Ибрагим → Ипкей. Такой процесс характерен для многих фамилий Поволжья и Урала. Менее вероятная, но возможная версия связывает «ипке» с диалектным тюркским словом, означающим «мягкий», «нежный», — такое прозвище могли дать спокойному человеку.

Географически фамилия Ипкеева встречается в регионах с исторически смешанным русско-тюркским населением: в Татарстане, Башкортостане, Оренбургской области. Носители фамилии, скорее всего, потомки служилых татар или башкир, которые переходили на русскую службу и получали фамилии по имени отца. Суффикс -ев вместо более ожидаемого для татарских фамилий -ин (как в Ипкеин) указывает на то, что фамилия закрепилась в русской канцелярской среде, где окончание подгоняли под стандартную модель «сын такого-то».

Сословно предки Ипкеевых могли быть как крестьянами, так и мещанами или казаками — точных данных нет, но сама модель фамилии (от имени, а не от прозвища по ремеслу) говорит о том, что родоначальник не был выходцем из низов, получившим фамилию по занятию. Фамилия не дворянская, но и не «уличная» — она официально зафиксирована в документах.

Если сравнивать с однокоренными, то встречаются варианты Ипкеев, Ипкин, Ипкаев — все они восходят к тому же имени Ипкей или его краткой форме Ипка. Разница в суффиксах ( -ев / -ин / -аев ) объясняется местными особенностями произношения и записи в метрических книгах.