Фамилия Исагаков — редкий случай, где тюркское имя встретилось с русским патронимическим суффиксом, но не самым привычным способом. Если бы мы ждали стандартной модели, то получили бы «Исаков» (от имени Исак, русская форма библейского Исаака). Здесь же основа — тюркское Исага, что сразу меняет картину.

Имя Исага (или Исака) — это сложносоставное тюркское имя, где первая часть «Ис-» восходит к арабскому «Иса» (Иисус в исламской традиции, почитаемый как пророк). Вторая часть — «ага» (господин, старший, уважаемый человек). Получается «господин Иса» или «старший Иса» — имя-пожелание, подчеркивающее почтение и авторитет. Встречается у многих тюркских народов: татар, башкир, казахов, ногайцев, но особенно характерно для казанских татар и мишарей.

Суффикс «-ов» в фамилии Исагаков указывает, что её формирование происходило в среде, где уже действовали русские административные нормы — скорее всего, после переписи или при получении паспорта в XIX веке. Интересно, что исходное имя Исага могло быть не только личным, но и прозвищем для уважаемого человека по имени Иса — то есть фамилия могла закрепиться за потомками такого «Исы-ага».

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская область. Встречается она редко, что говорит о локальном бытовании — возможно, от одного родоначальника в конкретном селе. В отличие от массовых татарских фамилий на «-ов» (Сайфутдинов, Хасанов), Исагаков сохранил более архаичную форму имени, не стёртую русским произношением.

Если сравнивать с однокоренными: Исаков — это прямая русификация библейского имени, Исаев — от арабского Иса (без добавки), а Исагаков — уникальный гибрид, где тюркский титул «ага» врос в основу. Предки носителя этой фамилии, скорее всего, были людьми заметными в своей общине: не рядовыми крестьянами, а, возможно, сельскими старостами, муллами или зажиточными хозяевами, которых окружающие называли почтительно — Исага.