Фамилия Исааков — один из тех случаев, когда происхождение видно почти сразу, но за простотой кроются важные детали. Она образована от канонического мужского имени Исаак, которое пришло в русский язык вместе с христианством из древнееврейского. Имя означает «смех» или «он засмеётся» — по библейскому сюжету, так назвали сына Авраама и Сарры, потому что престарелая мать, узнав о беременности, рассмеялась.

Модель образования фамилии — типичная для русских отчеств на -ов. Суффикс -ов присоединялся к основе имени, оканчивающейся на твёрдый согласный: Исаак → Исааков («сын Исаака»). Но не всё так однозначно. В русской народной традиции имя Исаак часто переделывали в более привычные формы — Исакий, Исак, Исака. Поэтому фамилия Исааков могла закрепиться не напрямую от полной церковной формы, а от разговорного варианта Исаак, который в быту звучал как Исак. Соответственно, в документах встречается и написание Исаков — это не ошибка, а параллельная форма, возникшая из-за редукции гласных.

Главная особенность фамилии — её относительная редкость в сравнении с «Исаевым» или «Исаковым». Это указывает на то, что она могла быть искусственно закреплена в среде, где имя Исаак употребляли строго по церковным святцам, без народного упрощения. Чаще всего такие фамилии встречались в среде духовенства или в купеческих родах, где следили за точностью записи. В крестьянской среде, где имя чаще звучало как Исак, и фамилию записывали соответствующую — Исаков.

С точки зрения словообразования, фамилия Исааков стоит в одном ряду с такими же «длинными» отчествами от библейских имён: Ааронов, Иеремиев, Иезекиилев. Все они несли на себе печать книжной, грамотной традиции. Если ваш предок носил фамилию Исааков, он, вероятно, происходил из семьи, где имя давали по полной церковной форме, а не по народному обиходу — это могло быть связано с принадлежностью к причту или к старообрядческой среде, где строго соблюдалось написание имён по святцам.

Встречается фамилия и у еврейских носителей, но там она образуется по той же модели, что и у русских: от имени Исаак (Ицхак) с патронимическим суффиксом -ов, который в Российской империи часто добавляли к фамилиям всех подданных независимо от вероисповедания. Различить русское и еврейское происхождение можно только по дополнительным данным: географии, сословной принадлежности, документам.