Фамилия Исахметов — яркий пример того, как русская фамильная модель соединилась с тюркским именем. В её основе лежит мужское личное имя Исахмет, которое распространено у татар, башкир и других тюркских народов Поволжья и Приуралья. Это имя составное: первая часть «Ис-» восходит к арабскому «Иса» (Иисус, пророк в исламе), а вторая — «-ахмет» (вариант имени Ахмад, «достохвальный»). Таким образом, Исахмет означает «Иса-Ахмад» или «восхваляющий Ису», что отражает традицию давать детям имена, сочетающие в себе религиозные смыслы. Ударение в исходном имени, скорее всего, падает на последний слог — Исахме́т.

Фамилия образована по русской притяжательной модели с помощью суффикса -ов. В среде татарских и башкирских мусульман, которые в XIX–XX веках активно переходили на фамилии, к именам отцов добавляли именно этот суффикс, а не тюркский -лы или -улы. Исахметов буквально значит «сын (или потомок) Исахмета». Этот способ словообразования — один из самых массовых в русском ономастиконе, но в сочетании с тюркским именем он даёт чёткую этническую и региональную привязку.

Географически фамилия Исахметов тяготеет к территориям с компактным проживанием татар и башкир: Татарстан, Башкортостан, Оренбургская, Челябинская области, а также отдельные районы Ульяновской и Самарской областей. Встречается она и у казахов, где имя Исахмет также бытует, но там фамилии чаще оформляются казахскими окончаниями (-улы, -кызы) или просто закрепляются в форме Исахмет, без русского суффикса. Русская же модель «-ов» указывает на то, что предки носителя фамилии жили в зоне активного межэтнического контакта и приняли фамилию по российским административным нормам.

Нередко фамилию путают с однокоренными Исаметов и Исмаметов. Разница в том, что в основе Исахметова лежит полная форма имени, где «х» чётко слышится и пишется. В диалектах могло происходить стяжение — Исамет, но в официальных документах чаще фиксировали именно вариант с «х», как более близкий к арабскому оригиналу. Социальный статус предков, как правило, был крестьянским: татары-земледельцы, реже — ремесленники или торговцы. Дворянских родов с такой фамилией в Российской империи не зафиксировано, что тоже типично для поздних фамилий, возникших в среде податных сословий.