Фамилия Исаянц — один из тех случаев, когда в одной фамилии сталкиваются сразу две языковые традиции: армянская основа и русский (или, шире, восточнославянский) способ оформления. Если отбросить конечное -ц, перед нами типичная армянская фамилия Исаян, образованная от имени Исай (библейское Исайя, в армянской традиции — Есаи). Суффикс -ян — самый распространённый патронимический показатель в армянском языке, означающий «принадлежащий к роду такого-то». То есть Исаян — «потомок Исая».

Но в русском языке, а точнее в его южнорусских и донских говорах, у фамилий на -ян часто появлялось окончание -ц. Это явление хорошо известно ономастам: так, на Кубани, Дону и в Ставрополье армянские фамилии нередко русифицировались, приобретая типичный для местных фамилий суффикс -ов, или же, что реже, получали окончание -ц. В случае с Исаянц мы видим не суффикс, а наращение -ц, которое могло возникнуть под влиянием русских фамилий на -ец (вроде Кузнецов — Кузнец) или как графическая адаптация армянского окончания -янц, которое в самой Армении тоже встречается, но реже. Впрочем, форма Исаянц более характерна именно для армян, живших в Российской империи за пределами Закавказья — в среде, где фамилию записывали по-русски и стремились придать ей более привычное для местного уха звучание.

Основа фамилии восходит к церковному имени Исайя (древнееврейское «спасение Господне»). В армянском аналоге — Есаи — это имя носил, например, знаменитый средневековый книжник Есаи Нчеци. Таким образом, предок носителя фамилии Исаянц, скорее всего, был человеком, которого в общине знали по имени Исай (или Есаи), а его дети и внуки уже стали Исаянами. Когда же семья переселилась в регионы с преобладающим русским населением — на Северный Кавказ, в Крым или в центральные губернии, — фамилия получила характерный «русский» хвостик -ц, закрепившийся в документах.

Отдельного внимания заслуживает то, что Исаянц — фамилия не самая частая. Она встречается в основном на юге России, в Краснодарском и Ставропольском краях, а также в Ростовской области. В самой Армении форма Исаянц почти не бытует: там стандартом остаётся Исаян. Поэтому по фамилии можно с определённой долей уверенности предположить, что её носители — потомки армян, переселившихся на Кубань или Дон во второй половине XIX — начале XX века, возможно, из Нагорного Карабаха или Зангезура, где имя Есаи было особенно популярно.