Фамилия Исаакянц — один из тех случаев, когда окончание сразу выдает происхождение. Суффикс -янц (в русской передаче) характерен для фамилий, сформировавшихся на восточноармянской территории, в отличие от западноармянского окончания -ян. Носители таких фамилий — потомки переселенцев, которые оказались в Российской империи, где окончание на твёрдое -ц закрепилось как калька с армянского родительного падежа множественного числа (буквально «из рода Исааков»).

В основе фамилии лежит библейское имя Исаак (др.-евр. Ицхак — «будет смеяться», «смеющийся»). У армян это имя обрело форму Исаак или Сак, и от него образовали отчество с патронимическим суффиксом -янц (чья семья? — Исаакянц). Таким образом, прямой смысл фамилии — «потомок Исаака» или «из дома Исаака».

В армянской ономастике фамилии на -янц считаются более архаичными, чем на -ян. Они указывают на род, а не на отдельную ветвь. Если фамилия Исаакян могла возникнуть у любого носителя имени, то Исаакянц — это маркер целого клана, что особенно характерно для фамилий, сложившихся до XIX века среди ремесленников и купцов Закавказья.

Интересная деталь: в русских метрических книгах XIX века фамилию могли записывать двояко — Исаакянц и Исаакьянц (через мягкий знак). Второй вариант отражает армянское произношение, где я после гласного звучит как йа. Однако в советских паспортах форма с твёрдым разделителем (Исаакянц) стала преобладать, так как она проще для русской орфографии.

Сословная принадлежность предков не восстанавливается по самой фамилии. Среди носителей Исаакянц встречались и тифлисские ремесленники, и нахичеванские купцы, и священники Армянской апостольской церкви. Единственное, что объединяет всех — происхождение из среды армян, говоривших на восточном диалекте, и связь с регионом, где армянские кланы фиксировали родовую принадлежность через суффикс -янц.