Фамилия Исеналиева — типичный пример фамилии, сложившейся в тюркоязычной среде, скорее всего в казахской или киргизской. Её основа — мужское личное имя Исенали. Оно составное: первая часть «Исен» (вариант «Есен») восходит к тюркскому «есен» — «здоровый, невредимый, благополучный». Вторая часть — «Али» — арабское имя, означающее «возвышенный, великий». Таким образом, имя Исенали можно перевести как «здоровый и великий» или «благополучный Али», что было типичным пожеланием благополучия и силы для ребёнка.

Фамилии на «-ева» в этой традиции — женская форма (дочь или жена Исенали). Мужской вариант — Исеналиев. Окончание «-ев» (а не «-ов») указывает на то, что основа имени заканчивается на мягкий согласный или «и»: Исенали → Исеналиев. Это стандартная русификация фамилий, которая происходила в XIX–XX веках при записи в метрики и паспорта.

Носительница фамилии, скорее всего, происходит из рода, где предка звали Исенали. Поскольку имя было личным, а не сословным, предки могли быть и скотоводами, и земледельцами, и воинами. В ономастике такие фамилии называют «патронимическими» — по имени отца или деда. Географически фамилия Исеналиева чаще всего встречается в Казахстане и Киргизии, реже — среди татар и башкир. В русской среде она почти не бытует, что сразу выдаёт её восточное происхождение.

Особенность фамилии в том, что она сохранила архаичную форму имени, где «Исен» (с начальным «И») — более старый вариант, чем распространённый сегодня «Есен» (с «Е»). В современных казахских именах чаще пишут Есенали, но в фамилиях закрепилась дореволюционная запись. Если искать однокоренные фамилии, то это Исенов, Есенов, Исенбаев — все они построены по одной модели от того же корня со значением здоровья и благополучия.