Фамилия Ищанова — это не самостоятельная основа, а фонетический вариант более распространённой фамилии Ишанов. Разница в одну букву («щ» вместо «ш») возникла, скорее всего, в устной речи под влиянием акающих говоров или при записи фамилии на слух, когда звук смягчили. Такие замены — обычное дело для фамилий, которые бытовали в среде с низкой грамотностью: писарь записывал прозвище так, как слышал от самого носителя.

Основа у обеих фамилий одна — древнее имя или прозвище Ишан. В тюркских языках слово «ышан» восходит к глаголу со значением «верь», «доверяй». Но бытовое значение было куда весомее: у народов, исповедующих ислам, ишан — это не просто имя, а почётный титул. Так называли суфийского наставника, духовного учителя, знатока Корана, человека, известного благочестием и способностью толковать священные тексты. Ишан — фигура, к которой шли за советом и наставлением, поэтому прозвище могло закрепиться за реальным религиозным деятелем или за тем, кто в своей общине исполнял роль учителя.

Модель образования типична для русских фамилий тюркского происхождения: к основе Ишан добавили патронимический суффикс -ов (в женском варианте — -ова). Суффикс указывает на принадлежность: «сын Ишана» или «из рода Ишана». Вариант Ищанов — та же модель, но с изменённой основой.

Географически фамилия Ищанова встречается реже, чем Ишанова, и тяготеет к регионам с татарским и башкирским населением, а также к районам, где исторически селились казахи и другие тюркоязычные народы. В метрических книгах XIX века обе формы могли записывать даже в одной волости — строгой орфографической нормы для таких фамилий не существовало.

Таким образом, предок носителей фамилии Ищанова — человек, которого в его окружении называли Ишаном. Он мог быть либо уважаемым религиозным наставником, либо просто получил это прозвище за учёность и набожность. Фамилия не указывает на дворянское происхождение или принадлежность к купечеству — скорее, это родовое именование крестьянской или духовной среды, где имя-титул передалось по наследству как фамилия.