Фамилия Ишеков образована по самой распространённой в русской ономастике модели — с помощью патронимического суффикса -ов. Она указывает на принадлежность предку, которого в обиходе называли Ишек. Разбираем это имя-прозвище.

Основа «Иш-» восходит к тюркским языкам, где слово «иш» означает «работа, дело, занятие». В тюркских именах и прозвищах этот корень встречается часто: Ишбай, Ишмурат. Однако в русской среде форма Ишек могла возникнуть двумя путями. Первый — как уменьшительно-ласкательное от имени Иш (или Иша), которое давали ребенку в смешанных русско-татарских семьях или в регионах с сильным татарским влиянием. Второй — как прозвище работящего, делового человека: «иш» плюс русский уменьшительный суффикс -ек (сравните: Ваня — Ванек, Петя — Петека). В пользу этого говорит то, что суффикс -ек в тюркских именах нехарактерен, а в русском просторечии он типичен для ласкательных форм.

Географически фамилия тяготеет к Поволжью и Уралу — зонам активного русско-тюркского контакта. Встречается она и у русских, и у татар, и у башкир, что объяснимо: в этих краях тюркские корни в русских фамилиях — обычное дело. Сословного барьера у Ишековых не было: фамилию могли носить и крестьяне, и мещане, и служилые люди (например, толмачи или казаки, контактировавшие с тюркским населением).

С точки зрения словообразования фамилия Ишеков стоит в одном ряду с Ишеев, Ишев, Ишков. Разница в суффиксах: -ев и -ов чередуются по фонетическому принципу (после мягкого согласного пишется -ев), а -ков — более редкая форма с присоединением суффикса -к- к основе. Фамилия Ишеков — самая прямая и прозрачная: она буквально говорит «сын Ишека», где Ишек — либо уменьшительное имя, либо прозвище по характеру занятия.