Скорее всего, фамилия Ишкуло образована от имени Ишкул, состоящего из двух компонентов: «иш» - «четный, парный; товарищ, друг, помощник; ровня, равноценный, подобный; народ, семья, род» и «кул» - «раб». Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, в основе этой фамилии лежит литовское слово iškyla - «пучина».