Фамилия Ишкуватова образована от мужского имени Ишкуват — диалектного варианта тюркско-татарского имени Ишкуат. На русский язык это имя переводится как «увеличивающий численность и мощь рода». В основе лежит сложение двух корней: «иш» (дело, работа) и «куат» (сила, мощь), что в сумме даёт значение «приумножающий силу рода», то есть тот, кто продолжает род и делает его крепче.

Родители, называя сына Ишкуватом, желали ему стать отцом многочисленной семьи. В мусульманской культуре способность иметь детей считалась величайшей благодатью Аллаха, а брак заключали не только для удовлетворения плотских потребностей, но прежде всего для того, чтобы родить и вырастить достойных детей. Появление каждого нового человека воспринималось как один из самых значительных даров, и шариат подробно оговаривал действия родных в связи с рождением ребёнка.

Фамилия Ишкуватова закрепилась по типичной для тюркских народов модели: к основе имени (Ишкуват) добавили русский патронимический суффикс -ов/-ев, а затем — окончание -а, указывающее на женский род. Изначально так называли жену или дочь Ишкувата: «чья?» — Ишкуватова. Со временем форма закрепилась как общая фамилия для всей семьи.

Процесс формирования фамилий у тюркских народов был длительным, поэтому точно определить, когда и где именно возник род Ишкуватовых, можно только по результатам генеалогических исследований. Однако ясно, что фамилия восходит к дохристианскому имени и сохраняет память о ценностях, которые ставили во главу угла предки: сила рода и продолжение семьи.