Фамилия Ишмуллина — женская форма мужской фамилии Ишмуллин. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: к основе мужской фамилии добавили окончание -а, указывающее на принадлежность женщине. Искать её происхождение нужно в мужском варианте.

Ишмуллин — фамилия тюркского, скорее всего башкирского или татарского, корня. В её основе лежит составное арабское имя Ишмулла. Первая часть «иш» восходит к слову «друг, товарищ» (в некоторых тюркских языках), вторая — «улла» от арабского «Аллах». Таким образом, имя Ишмулла означает «друг Аллаха» или «товарищ Бога». Это имя давали мальчикам, желая им божественного покровительства и дружбы с Всевышним.

Русский суффикс -ин в фамилии Ишмуллин (а не -ов) не случаен. В тюркских языках, в отличие от славянских, притяжательность часто выражается через суффикс -ин/-ын. Фамилия Ишмуллин буквально означает «сын Ишмуллы», «принадлежащий Ишмулле». Такая модель образования фамилий характерна для татар и башкир, которые в XIX — начале XX века массово получали русские фамилии по отцу.

Географически фамилия Ишмуллина и её мужской вариант Ишмуллин чаще всего встречаются в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях. Носители этой фамилии — потомки тех, кто носил имя Ишмулла. Сословно предки могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми, торговцами — имя не несло социальной окраски, а было религиозно-пожелательным.

Интересная деталь: ударение в фамилии чаще падает на второй слог — Ишмýллина, хотя встречаются варианты с ударением на первый. Это объясняется разной интонацией в тюркских языках-источниках, где ударение не фиксировано так жёстко, как в русском.