Фамилия Исмуллина — женская форма фамилии Исмуллин, и её происхождение стоит искать в мужском имени или прозвище. Основа фамилии — тюркское имя Исмулла или Исмуллах. Это сложносоставное имя, где первая часть «Ис-», скорее всего, восходит к арабскому корню «исм» — «имя», а вторая часть — «улла» или «уллах» — «Аллах». Таким образом, имя Исмулла можно перевести как «имя Аллаха» или «носящий имя Бога». Это типичная для исламского именника модель, где имя включает в себя эпитет или указание на божественное.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Исмуллин — «сын Исмуллы» или «потомок Исмуллы». Такая модель образования фамилий (от имени отца через притяжательное прилагательное) характерна для русской среды, куда фамилия попала через процессы обрусения тюркских и мусульманских имен. В среде татар, башкир и других народов Поволжья и Приуралья фамилии на «-ин» и «-ов» стали массово закрепляться в XIX — начале XX века, когда проводились переписи и ревизские сказки.

Географически фамилия Исмуллина чаще всего встречается в Башкортостане и Татарстане, а также в соседних областях — Оренбургской, Челябинской, Самарской. Носители фамилии в подавляющем большинстве — потомки башкир или татар, принявших фамилию по отцу. В дореволюционных записях можно встретить варианты написания: Исмуллин, Исмулла, Исмулов — последний вариант показывает, как имя адаптировали под более привычную модель с суффиксом «-ов».

С точки зрения социальной истории, предки Исмуллиных не относились к дворянству или купечеству. Это фамилия крестьянского или мещанского сословия, что подтверждается частотностью в деревнях и сёлах. Имя Исмулла не было редким, но и не входило в число самых распространённых, поэтому фамилия остаётся локальной, не размытой по всей стране. Единственное, что можно сказать с уверенностью: её носители — люди, чьи предки исповедовали ислам и жили на территории современного Южного Урала или Заволжья.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями вроде Исмагилов, Исматов или Исхаков, то Исмуллин стоит особняком из-за редкого сочетания «Ис-» с «-улла». В то время как «Исмагил» — это арабское имя Исмаил (библейский Измаил), «Исмулла» — имя, прямо отсылающее к атрибуту Бога, а не к пророку. Это делает фамилию более маркированной в религиозном смысле, хотя со временем это значение стёрлось.