Фамилия Исмуллин в своей основе несёт два пласта — тюркский и арабский, и её разбор даёт ключ к возможному происхождению предков. Словообразовательная модель здесь ясна: фамилия образована с помощью русского патронимического суффикса -ин, который в русской традиции присоединяли к основам на -а или согласный (сравните: Ильин, Пушкин). Основа — Исмулла, которая в свою очередь является стяжённой формой от арабо-тюркского имени Исмагул или Исмулла.

Само имя Исмулла (или Исмагул) — сложное. Первая часть восходит к арабскому Исм («имя»), в религиозном контексте часто означающему «имя Аллаха». Вторая часть — улла (от «Аллах») или гул (тюрк. «раб», «слуга»). Таким образом, исходное имя — Исмулла — можно перевести как «имя Аллаха» или, если вторая часть — гул, как «раб имени (Аллаха)». Это типичная для мусульманского именослова конструкция, где личное имя становилось богословским утверждением или посвящением.

Географически фамилия Исмуллин прочно привязана к регионам с тюркским и финно-угорским населением, принявшим ислам. Она распространена среди башкир, татар, а также встречается у чувашей. В Башкортостане и Татарстане её носители — не редкость. Это указывает на то, что предок носителя фамилии, скорее всего, был крестьянином или воином из этих народов, которому при переписи населения или при получении паспорта в XIX–XX веках фамилию дали по имени отца — Исмуллы.

В отличие от многих русских фамилий на -ов, суффикс -ин здесь не указывает на принадлежность к чему-то вещественному (как в случае с «Соколов» — от сокола), а прямо фиксирует родство: «чей сын? — Исмуллин». Это типичный случай, когда фамилия, звучащая по-русски, скрывает за собой глубокий пласт исламской и тюркской культуры. Никакой другой — более древней или славянской — версии происхождения у этой фамилии нет; все попытки вывести её из русского «исмулить» (несуществующий глагол) — лингвистический курьёз.