Фамилия Иштокины — редкий пример того, как в русской фамильной модели могло закрепиться слово с неочевидной этимологией. Внешне она выглядит как типичная русская фамилия с суффиксом -ин, который указывает на принадлежность: Иштокин буквально значит «сын Иштока» или «человек из рода Иштока». Но что стояло за прозвищем Ишток — вопрос, на который нет однозначного ответа, и здесь открывается поле для гипотез.

Первая и наиболее прямая версия отсылает к еврейскому слову «ишток», означающему «молчание». Если это так, то прозвище Ишток мог получить человек неразговорчивый, молчаливый. Такие прозвища по чертам характера — обычное дело в ономастике, и фамилия Иштокин вписалась бы в ряд с Молчановыми или Тишиными, но с более редкой основой.

Вторая версия уводит в тюркские языки. Здесь возможны два корня: «ишти» («живот») и «иште» («работа»). Первый вариант даёт прозвище любителю плотно поесть (ср. русское Брюханов), второй — трудолюбивому человеку (аналог Работягиных). Оба объяснения лингвистически состоятельны, но требуют допущения, что тюркское слово было адаптировано русским ухом до формы Ишток.

Словообразовательная модель фамилии — суффикс -ин — указывает, что она сформировалась в среде, где фамилии давали по отцу. Это характерно для центральных и северных регионов России, а также для некоторых групп крестьянства. Встретить носителей фамилии Иштокины можно и сегодня, но статистика по ней скудная: фамилия редкая, не входит в списки распространённых русских фамилий.

Точное время возникновения фамилии Иштокин установить трудно — процесс закрепления прозвищ в фамилии шёл на протяжении нескольких столетий, с XV по XIX век. Однако сам факт, что фамилия сохранилась и дошла до наших дней, говорит о том, что за ней стоит конкретная семейная история, пусть и не записанная в документах.