Фамилия Исинбаев — тюркская по происхождению, и её разбор стоит начать с корня. Основа «Исин» восходит к мужскому личному имени Исин, которое в свою очередь образовано от тюркского слова «исен» (здоровый, благополучный, невредимый). В башкирском, татарском и казахском языках это имя имело пожелательный смысл: родители называли так сына в надежде на его крепкое здоровье и удачную судьбу. Суффикс «-бай» — один из самых частых в тюркской антропонимии, он означает «богатый», «господин», «хозяин». Таким образом, имя Исинбай буквально переводится как «здоровый и богатый» или «богатый здоровьем».

Фамилия Исинбаев образована по русской модели отчества: к основе Исинбай добавили патронимический суффикс «-ев» (после мягкого согласного «й»). Так тюркское имя превратилось в фамилию, закрепившуюся у башкир, татар и казахов. Встречается она преимущественно в Башкортостане, Татарстане, Оренбургской и Челябинской областях, а также среди казахского населения. Вариант написания с двумя «с» (Иссинбаев) встречается реже, но возможен — из-за двойной «с» в исходном имени в некоторых диалектах.

Интересная деталь: фамилия Исинбаев нередко соседствует с однокоренной Исинбаевой (женская форма) и фамилией Исинбаевых, но в отличие от многих других тюркских фамилий, она почти не имеет вариантов с другим суффиксом (например, Исинбаков или Исинбаевский). Это говорит о том, что фамилия сложилась поздно, уже в XIX веке, когда русская администрация фиксировала фамилии по единому образцу. Предки носителей фамилии, скорее всего, были скотоводами или земледельцами, а само имя Исинбай указывает на то, что в роду ценили здоровье и достаток — базовые ценности кочевого быта.