Фамилия Ивунин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Ивунин послужило церковное имя Иоанн. Фамилия Ивунин восходит к каноническому мужскому личному имени Иоанн (в переводе с древнееврейского – «милость Божья»). От него было образовано множество производных разговорных форм, одна из которых — Ивуня — и легла в основу данной фамилии. Известно, что в древней Иудее это имя произносилось как Йоханаан. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Ивуня, со временем получил фамилию Ивунин. О точном месте и времени возникновения фамилии Ивунин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Ивунин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.