Фамилия Июдин — одна из тех, где церковное имя дало неожиданную бытовую форму. В её основе лежит имя Июда — народный, упрощённый вариант библейского имени Иуда (Йехуда). С иврита оно переводится как «восхваляющий Бога» или «прославленный». В русской среде имя Июда, в отличие от полной формы, не несло негативного евангельского оттенка, а воспринималось как обычное крестильное имя.

Образована фамилия по простейшей модели: к основе Июд- добавили суффикс принадлежности -ин. В древнерусской традиции этот суффикс означал «чей?» — то есть Июдин буквально значило «сын Июды» или «потомок Июды». Такая модель типична для фамилий, возникших в крестьянской и мещанской среде: она дешевле и естественнее, чем искусственные семинарские формы на -ский.

Любопытно, что при всей прозрачности корня фамилия встречается редко. В дореволюционных переписях Июдины фиксировались в основном в центральных губерниях, а после революции рассеялись. В современной России фамилия остаётся малочисленной, но не исчезла — её носители живут и в городах, и в сёлах.

С точки зрения словообразования фамилия однозначна: это отчество от имени Июда. Споров между лингвистами нет — все сходятся на библейском корне. Сравните с однокоренными фамилиями Юдин, Иудин, Иудашкин: все они восходят к одному источнику, но различаются степенью адаптации имени в народной речи. Июдин — самая русифицированная форма, где начальное «и» сохранилось, а ударение осталось на втором слоге.