Фамилия Изенекова восходит к прозвищу Изенек, которое образовано от марийского «изи» - «маленький». Следовательно, Изенеком могли назвать младшего ребенка в семье. Однако в основу фамилии могло лечь и марийское «изай» - «старший брат». Так или иначе, фамилия была связана с указанием на степень родства, что было характерно для первобытно-общинного строя. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Изенек, со временем получил фамилию Изенекова.