Фамилия Изгородин (и её форма множественного числа — Изгородины) образована от прозвища, а не от крестильного имени. Основа здесь — нарицательное «изгородь», то есть ограда из жердей, прутьев или штакетника. В русских говорах существовал и вариант «изгорода». Человек мог получить такое прозвище, если его усадьба была обнесена заметной, добротной изгородью — это указывало на хозяйственность и определённый достаток. В «Ономастиконе» С. Б. Веселовского зафиксировано прозвище Изгорода: Иван Григорьевич Билибин, 1534 год. Эта запись — одно из ранних документальных свидетельств того, что прозвище бытовало уже в первой половине XVI века.

Модель образования фамилии проста и типична для русского севера и центра: к основе на -а/-я (Изгорода) добавился суффикс -ин, указывающий на принадлежность: «чей?» — Изгородин, то есть сын или потомок Изгороды. Фамилия Изгородины (во множественном числе) означает «семья, род Изгородиных».

Обратите внимание, что фамилия не связана с каким-либо одним регионом — изгородь как элемент быта была повсеместна, поэтому Изгородины встречаются и в центральных областях, и на Урале, и в Сибири. В написании встречаются варианты Изгородин и Изгородина, но нормативная фамильная форма — Изгородин.