Фамилия Ижукова — женская форма от Ижуков, и её разумнее всего разбирать через мужской вариант. Перед нами типичная русская фамилия, образованная суффиксом -ов от прозвища или имени Ижук. С этимологической точки зрения здесь два основных пути, и оба ведут к живой народной речи.

Первый и самый вероятный вариант: основа Ижук — это фонетический вариант слова «ежук» (ёжик). В русских говорах, особенно северных и северо-западных, «еж» нередко произносили как «иж», «ижа». Отсюда «ижук» — маленький ёж. Прозвище Ижук могли дать человеку колючему, неуживчивому, с торчащими волосами или, наоборот, свернутому в комок, домоседу. В ономастике это известная модель: фамилии Ежов, Ежиков, Ёжиков идут тем же путём, но Ижуков — редкий диалектный след.

Вторая версия, менее распространённая, но имеющая право на существование: Ижук как производное от канонического имени Иоанн (Иван) через уменьшительную форму Иж, Ижа. В некоторых регионах «Ижа» или «Ижута» фиксировались как народные варианты Ивана. Тогда Ижук — «маленький Иван», а Ижуков — «сын Ижука». Однако эта гипотеза слабее: для уменьшительных форм от Иван в русском языке куда типичнее суффиксы -ушк, -юшк, -аня, -аха, а «ижук» больше похож на прозвищное, а не на крестильное производное.

Суффикс -ов указывает на отчество или принадлежность: Ижуков буквально значит «сын Ижука». Фамилия недворянская, скорее всего крестьянская или мещанская. Географически она редкая, встречается в основном в центральных и северных областях России, где сохранялось оканье и диалектное «иж» вместо «еж». Встретить Ижуковых можно в Вологодской, Архангельской, Кировской областях, а также среди старообрядческих семей, которые дольше хранили архаичную речь.

Известных исторических носителей, вошедших в энциклопедии, нет — фамилия осталась в тени массовых Ежовых. Но именно это и делает её ценной для семейной истории: по фамилии можно с большой долей уверенности определить, что предки жили в зоне севернорусских говоров и, скорее всего, получили прозвище за характер или внешность, а не за род занятий.