Фамилия Каклюгин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Прозвище Каклюга, вероятно, восходит к чувашскому слову «каклишка» - «костыль, клюка». Согласно этому, можно предположить, что такое прозвище мог получить хромой человек. По другой версии, в основе прозвища лежит эстонское слово kakleja («каклея») - «дебошир, драчун». В таком случае, основатель рода Каклюгиных мог быть вспыльчивым, заносчивым человеком. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Каклюга, со временем получил фамилию Каклюгин. О точном месте и времени возникновения фамилии Каклюгин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Каклюгин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.