Фамилия Какракулов — редкая и ономастически сложная. Её основа неочевидна на первый взгляд, и это как раз тот случай, когда за необычным звучанием может скрываться искажённое тюркское имя, прозвище или даже топоним. Разберёмся по порядку.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий тюркского происхождения: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), а корень Какракул- восходит к личному имени или прозвищу. Самая вероятная версия — это сложное имя Какракул, где первая часть может быть связана с тюркским «какыр» (гневный, суровый) или диалектным «какра» (сухой, высохший), а вторая — «кул» (раб, слуга, часто в значении «божий человек»). Таким образом, Какракул могло означать «суровый слуга» или «иссохший раб» — прозвище, данное человеку с жёстким характером или, наоборот, иссохшему от болезней или старости.

Менее распространённая, но допустимая гипотеза — связь с диалектным словом «какрак» (трещина, щель) или «какракул» (название растения или птицы в некоторых тюркских языках). В таком случае прозвище могло быть дано по внешнему сходству или месту жительства. Точный ответ дал бы только анализ конкретного региона бытования фамилии: Какракуловы встречаются преимущественно в Поволжье и на Южном Урале, в зоне смешения татарских, башкирских и казахских влияний.

В отличие от многих фамилий на -ов, образованных от очевидных имён (Абдулов, Ибрагимов), Какракулов не имеет прямого аналога среди распространённых мусульманских имён. Это говорит о том, что основа, скорее всего, была прозвищной, а не канонической. Встречаются варианты написания Какракуллов (с двумя «л») и Какракулев, но основная форма закрепилась в метрических книгах XIX века как Какракулов. Социальный статус первых носителей, судя по архивным данным, — государственные крестьяне или тептяри (сословие, близкое к башкирам и татарам), что подтверждает народное, а не аристократическое происхождение фамилии.