Фамилия Какшаров образована от прозвища или нецерковного имени Какшар. Основа здесь — тюркское «какша» или «какшан», что в ряде тюркских языков означает «сухой, засохший, хилый». Скорее всего, прозвище давали человеку худощавого телосложения, болезненному или просто очень сухому, жилистому. В тюркской среде такие имена-обереги были распространены: считалось, что «плохое» имя отпугнет злых духов и ребенок вырастет здоровым вопреки прозвищу.

Суффикс -ов указывает на русскую модель образования фамилий, которая закрепилась в XVI–XVII веках. Какшаров — буквально «сын Какшара» или «принадлежащий Какшару». Важно, что суффикс не тюркский, а именно русский: это значит, что фамилия оформилась уже после того, как носитель тюркского прозвища или его потомки оказались в русскоязычной среде. Такое часто встречается на Урале, в Прикамье и в Поволжье, где русские фамилии возникали на базе местных тюркских или финно-угорских прозвищ.

Менее вероятная версия связывает Какшар с диалектным русским словом «какша» — так в некоторых говорах называли кашу или месиво. Тогда прозвище могло относиться к повару или человеку, который любил каши, но эта гипотеза слабее: слово «какша» в этом значении редкое и локальное, а тюркская основа встречается в антропонимии гораздо чаще.

Фамилия Какшаров — не массовая, но встречается в нескольких регионах. Ее география тяготеет к Уралу и Западной Сибири, что подтверждает версию о тюркском корне: именно через эти земли проходили пути тюркских народов, и здесь оседали их потомки, принимавшие русские фамилии. В дореволюционных переписях Какшаровы фиксировались в основном среди крестьян и мещан, то есть сословно фамилия не была аристократической.

Однокоренные фамилии — Какшаев, Какшин — встречаются реже, но построены по той же модели. Разница в суффиксе (-ев вместо -ов) может объясняться местными особенностями произношения или разной основой: Какшаев, вероятно, восходит к имени Какшай, где конечный звук «й» дал суффикс -ев.