Фамилия Калиныч нестандартна по своей модели: она образована не через привычный суффикс принадлежности (-ов, -ин), а через отчество на -ыч. Такая форма в XVI–XIX веках была распространена в северных и центральных губерниях России, а также в среде крестьян и мещан, где отчество могло закрепиться как фамилия. Чаще всего -ыч встречается в фамилиях, которые фиксировали имя отца напрямую, без дополнительных суффиксов (сравните: Кузьмич, Фомич, Ильич).

Основа фамилии — Калина. Это краткая форма крестильного имени Каллиник. Имя греческого происхождения: от слов kallos («красота») и nike («победа»), то есть в целом «добрый победитель». В народном обиходе длинное церковное имя сократили до Калины, и от этой формы пошло отчество Калиныч.

Есть и вторая версия: Калина могло быть мирским, нецерковным именем. В этом случае его давали по названию кустарника с красными ягодами — калины. Такие «растительные» прозвища были обычны в дохристианской и раннехристианской традиции: человека называли по растению, которое росло рядом с домом или символизировало какие-то качества. Мирское имя Калина встречается в старых документах, и оно не обязательно связано с крестильным Каллиником.

Какой из версий отдать предпочтение? Для фамилии Калиныч первая выглядит убедительнее. Дело в том, что отчества на -ыч почти всегда образовывали от полных или кратких форм крестильных имён (Иван → Иваныч, Пётр → Петрович), а мирские имена реже давали такие патронимы. Но полностью исключать «ягодную» версию нельзя: в некоторых регионах, особенно на юге и западе, мирские имена могли оформляться через -ыч.

Так или иначе, предок носителя фамилии Калиныч был сыном человека по имени Калина — либо Каллиника в просторечии, либо человека, прозванного в честь калинового куста. Фамилия редкая по словообразованию и чётко указывает на отчество, а не на прозвище или профессию.