Фамилия Калинычев — один из тех случаев, где за привычным звучанием скрывается спор о происхождении. Корень здесь может быть как церковным, так и сугубо народным, и обе версии имеют под собой почву.

Первая и наиболее вероятная гипотеза связывает фамилию с крестильным именем Каллиник (от греческих слов «каллос» — добрый, прекрасный и «нике» — победа, то есть «добрый победитель»). В русском быту это длинное и торжественное имя быстро сократили до более простых форм — Калина, Калиня, Калиныч. Суффикс «-ыч» в данном случае указывает на отчество: Калиныч — сын Калины (или Каллиника). А фамилия Калинычев — это уже «внук» или «потомок» того самого Калиныча. Такая модель образования (личное имя → отчество на «-ыч» → фамилия на «-ев») характерна для северных и центральных областей России, где патронимы на «-ич» долго сохранялись не только в дворянской, но и в крестьянской среде.

Вторая версия отталкивается от мирского имени Калиныч, которое давали ребенку в честь куста калины. В дохристианской традиции родители могли назвать сына по названию растения, чтобы, по поверьям, природа приняла его как своего и передала ему свои свойства — в случае с калиной это связывали с красотой, стойкостью и целебной силой. Имя Калина (и его производное Калиныч) встречалось на Руси независимо от церковного календаря, так что часть носителей фамилии Калинычев вполне могла вести род от человека, прозванного по ягоде.

Разобраться, какая версия верна для конкретной семьи, можно лишь по косвенным признакам: если в документах XVII–XVIII веков предок записан как Калиныч, а его отец — как Калина, скорее всего, мы имеем дело с мирским именем. Если же в той же местности встречается имя Каллиник, то фамилия, вероятно, «крестильная». В любом случае, обе линии сошлись в одной форме — Калинычев, которая закрепилась как фамилия примерно к концу XVII века.