Фамилия Кальмалькупкин — настолько редкая и необычная по звучанию, что сразу вызывает вопрос: откуда она? Её основа явно не славянская, а суффикс -ин указывает на русскую модель образования, типичную для фамилий от личных имён или прозвищ. Всё указывает на то, что перед нами русифицированная фамилия народа, говорящего на одном из тюркских или финно-угорских языков.

Первый и самый очевидный вариант — связь с народом селькупов. Селькупы — коренной народ Сибири, их самоназвание звучит как «шёлькуп» (таёжный человек) или «кумалькуп» (земляной человек). В основе фамилии лежит слово «кумаль» (земля) и «куп» (человек). Приставка «каль» может быть искажённым «кал» — рыба (на селькупском «кэлэ»). Таким образом, «Кальмалькупкин» могло означать «сын рыбного земляного человека» или, проще, «сын рыбака-селькупа». Суффикс -ин в русской среде добавили при записи фамилии, превратив этническое прозвище в наследственное имя.

Вторая версия, менее вероятная, но допустимая, — связь с тюркским корнем «кал» (оставаться) или «калмак» (остаток, калмык). В сочетании с «мал» (скот) и «куп» (много) это могло дать прозвище «Кальмалькуп» — «оставшийся со многим скотом», то есть богатый скотовод. Однако селькупское происхождение убедительнее, так как географически фамилии с основой на «-куп» (человек) встречаются именно в среде обских угров и самодийцев, а у тюрков такая модель редка.

Географически фамилия Кальмалькупкин должна быть привязана к Томской области или Красноярскому краю — местам традиционного расселения селькупов. Встречаемость её ничтожна, носители, скорее всего, потомки тех, кто вёл полукочевой образ жизни в тайге, занимался охотой и рыболовством. Русские чиновники и переписчики в XIX веке часто записывали такие фамилии на слух, отсюда и необычное сочетание слогов.

По сути, эта фамилия — этноним, перешедший в фамилию. Она не несёт в себе ни дворянского, ни крестьянского статуса в классическом понимании, а отражает родовую принадлежность к малому сибирскому народу. Её уникальность в том, что она сохранила в себе целую фразу из языка, на котором сейчас говорит лишь несколько тысяч человек.