Фамилия Калыпова — женская форма фамилии Калыпов. Её основа восходит к тюркскому корню, и разбирать её стоит с учётом языковой географии, а не славянских моделей. В русском языке фамилия оформлена типичным суффиксом -ов, который указывает на принадлежность («чей?»), но сама основа не имеет славянских корней.

Наиболее вероятное происхождение — от личного имени Калып. Это имя распространено у тюркских народов (татары, башкиры, казахи) и восходит к арабскому «халиф» (наместник, преемник). В тюркской фонетике начальный «х» часто переходит в «к», поэтому Калып — это адаптированная форма имени Халиф. Так могли назвать мальчика в честь религиозного или светского лидера, либо в знак уважения к статусу. Суффикс -ов в данном случае просто русифицировал имя, превратив его в фамилию: Калыпов — «сын Калыпа».

Есть и более бытовая версия. В некоторых тюркских диалектах «калып» означает «форма», «шаблон», «лекало». В этом случае прозвище Калып мог получить ремесленник — сапожник, литейщик или портной, работающий по готовым формам. Однако версия с именем выглядит предпочтительнее: личные имена в основе фамилий встречаются чаще, чем прозвища от предметов.

Фамилия Калыпова характерна для татар, башкир и народов Поволжья, где активно шла русификация тюркских имён в XIX веке. Встречается она и у казахов, но там чаще пишется без суффикса — просто Калып. В русской среде фамилия редкая, её носители — почти всегда потомки тех, кто перешёл на русское делопроизводство и получил фамилию по отцу.