Фамилия Калжанова — один из тех редких примеров, когда двусоставное имя-основа не скрывает, а, наоборот, проясняет значение. Её образовали от мужского личного имени Калжан, которое состоит из двух тюркских корней: «кал» (родинка) и «жан» (душа, человек). В переводе с татарского и казахского имя Калжан означает «душа с родинкой» или «человек с родинкой». В традиционной культуре родинка считалась особым знаком, поэтому ребёнку, родившемуся с родинкой, нередко давали имя с компонентом «кал» или «мин» (оба значат «родинка»).

Фамилия закрепилась по стандартной для тюркских народов модели: к основе Калжан прибавили русский патронимический суффикс -ов, а затем — окончание -а, указывающее на женский род. Мужской вариант фамилии — Калжанов. Суффикс -ов в этом случае не говорит о происхождении от русского имени, а лишь оформляет фамилию по русской грамматической норме, что типично для фамилий казахов, татар и других народов, вошедших в состав Российской империи.

Сведений о фамилии в архивных документах немного, но они показательны. В Сведениях ДКНБ РК по Костанайской области упоминается казах Калжанов Абильмахим, родившийся в 1885 году (Кустанайская обл., Убаганский р-н). В Сведениях ДКНБ РК по Актюбинской области зафиксирован Калжанов Балжан, рождённый в 1895 году (Актюбинская обл., Темирский р-н, аул 41). Оба носителя — казахи, что указывает на преимущественное бытование фамилии в северо-западных и центральных регионах современного Казахстана.

Словообразовательная модель здесь простая и прозрачная. В отличие от фамилий, образованных от прозвищ по ремеслу или внешности, Калжанова напрямую восходит к личному имени. Споров о значении корней почти нет: обе части хорошо известны в тюркской ономастике. Единственное, что может вызвать вопрос — вариант «кал» как «родинка» в некоторых диалектах звучит как «калъ», но смысл остаётся тем же.

Фамилия Калжанова — не массовая, но и не единичная. Её носители встречаются в Казахстане и среди тюркоязычных диаспор. Поскольку имя-основа Калжан было личным, а не прозвищным, фамилия не несёт указания на сословие или род занятий предков — она говорит лишь о том, что в роду был человек, которого назвали в честь приметной родинки.