Фамилия Канфарин — одна из тех, что ставит исследователя перед выбором: искать корни в русском языке или в тюркских наречиях. В русской ономастике она выглядит чужеродной: в ней нет ни одного из распространённых суффиксов притяжательности (-ов, -ин, -ский), которые обычно крепят фамилию к имени или прозвищу отца. Суффикс -ин здесь, на первый взгляд, есть, но он не тот, что в фамилиях вроде Пушкин или Кузьмин. В Канфарине -ин не является патронимическим, а входит в основу, и это первый признак того, что фамилия могла быть образована не от славянского слова, а от заимствованного.

Самая вероятная версия ведёт к тюркским языкам. В татарском, башкирском и казахском есть слово «канфар» — так называют камфару, ароматическую смолу, которую веками вывозили с Востока. Прозвище Канфар мог получить человек, торговавший этим товаром, или тот, кто занимался его переработкой — например, в мыловарении или медицине. В русских говорах слово «камфара» известно, но фамилия Канфарин, скорее всего, возникла в среде поволжских татар или башкир, где звук «ф» в начале слова не редкость, а окончание -ин добавилось уже при русификации, по аналогии с русскими фамилиями на -ин.

Есть и другая, менее очевидная версия — от арабского имени Канфар, которое встречается у мусульманских народов. В этом случае фамилия Канфарин означает «потомок Канфара», и суффикс -ин здесь уже работает как притяжательный, но только в русской записи. Спор между этими двумя гипотезами решается просто: прозвище по профессии всегда давалось чаще, чем имя по отцу, особенно в среде ремесленников и торговцев. Поэтому версия с камфарой выглядит правдоподобнее.

Фамилия редкая, в списках массовых русских фамилий не встречается. Географически её носители чаще всего фиксируются в Татарстане, Башкортостане, а также в Оренбургской и Челябинской областях — именно там, где столетиями жили тюркские народы в тесном контакте с русскими. Сословно Канфарины, скорее всего, были не дворянами, а мещанами или купцами средней руки — теми, кто вёл торговлю с Востоком. В дореволюционных метриках фамилия могла писаться по-разному: Канфаров, Канфарин, а иногда и через «о» — Конфаров, что только подтверждает её устное, не книжное происхождение.