Фамилия Карайчикова — форма женского рода, а её мужской вариант — Карайчиков. Сама фамилия редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, в её основе лежит прозвище или мирское имя, образованное от тюркского корня «карай» или «кара». В тюркских языках «кара» означает «чёрный», «тёмный», «суровый», «сильный». Это один из самых распространённых компонентов в тюркских прозвищах и именах (сравните Кара-Мурза, Кара-Курт). Слово «карай» может быть диалектным вариантом или производным от «кара» с добавлением аффикса.

Вероятнее всего, прозвище Карайчико (или Карайчик) дали человеку со смуглой кожей, тёмными волосами либо с суровым, «чёрным» нравом. Уменьшительно-ласкательный суффикс «-чик» в основе (Карай + чик) указывает на то, что прозвище закрепилось за молодым человеком или младшим членом семьи. Затем от этого прозвища образовалась фамилия с русским патронимическим суффиксом «-ов»: Карайчиков — то есть «сын Карайчика».

Есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «карай» могло означать род занятий — например, погонщика верблюдов или человека, связанного с караванами (от слова «караван»). Однако эта гипотеза слабее, так как слово «карай» в таком значении в русских говорах почти не фиксируется.

Географически фамилия Карайчикова встречается в Поволжье и на Южном Урале — в регионах, где исторически был силён тюркский субстрат и смешение русского и татаро-башкирского населения. Это косвенно подтверждает тюркское происхождение основы.

В написании фамилии обращает на себя внимание буква «й» в корне. Она сохраняет исходное звучание тюркского слова, что отличает фамилию от похожих, но более русифицированных вариантов (вроде Карачиков, где «ч» вытеснило «й»). Эта особенность — хорошая подсказка для тех, кто ищет свои корни в татарской или башкирской среде.